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[图标]KlusterCaller 4.1.2授权 [复制链接]

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1970-01-01
图酷模式  只看楼主 倒序阅读 使用道具 楼主  发表于: 2009-10-01 09:05:21

KlusterCaller 基因分型软件
KlusterCaller 支持基因分型数据分析和报告。可以从微孔板检测仪和 qPCR 仪器中导入 96、384 和 1536 孔板规格的数据。
我们的 KlusterCaller™ 软件是基因分型数据分析和报告模块的独立版本,内置于我们的 Kraken™ 工作流程管理软件中。当来自荧光读数仪的双发射基因分型数据导入 KlusterCaller 软件时,会自动为每次检测生成传统的簇图。软件中内置的专有算法可自动识别检测结果是等位基因 1 的纯合子、等位基因 2 的纯合子、杂合子还是不确定的。
KlusterCaller 能够导入、显示和导出 96 孔板、384 孔板和 1536 孔板格式的数据。
对于每个 KlusterCaller 项目,将在窗口左侧创建一个项目树(参见图 1)。这将详细说明项目中的所有主 DNA 板、项目中的分析以及基因分型簇图(在 “调用” 部分)。在 DNA 主板图中,可以将单个孔识别为 DNA 样品、无模板对照 (NTC) 或空孔。


图 1.KlusterCaller 项目窗口。项目树可用于导航到有关 DNA 母板、项目内的检测和基因分型检出结果的详细信息。
导入 KlusterCaller 项目的基因分型数据将显示为笛卡尔簇图(参见图 2)。FAM 值绘制在 X 轴上,HEX 值绘制在 Y 轴上。使用 ROX(惰性参比染料)的结果归一化可以手动打开或关闭。


图 2.KlusterCaller 基因分型结果。基因分型结果显示在聚类图中。蓝色数据点是 FAM 报告的等位基因的纯合子,绿色数据点是杂合子,红色数据点是 HEX 报告的等位基因的纯合子。黑色数据点表示无模板对照 (NTC),粉色数据点表示未确认。DNA 样品板布局显示在簇图下方。

联系1739083603@qq.com
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曹刘 电魂 +3 闪电联盟因你而精彩! 2009-10-01