qbase +是由Biogazelle开发的专业qPCR分析软件。qPCR或定量聚合酶链反应是一种基于聚合酶链反应(PCR)的实验室分子生物学。该反应的任务是在PCR期间立即监测DNA的复制。该软件专为qPCR分析而设计,可供生物学爱好者使用。Qbaseplus软件是可靠的qPCR分析工具,可以非常精确地向您显示该反应的结果。您只需将数据输入到该软件中,然后对其进行各种计算和分析。该软件的算法使您可以根据国际准则处理数据,而不必使用各种分析公式。 指尖可靠的结果
在得出结论之前,必须评估qPCR后数据的质量并丢弃不符合预定义标准的数据点。 这就是为什么qbase +提供几种类型的质量控制的原因。
容易上手
使用qbase +,您和您的团队可以开始进行qPCR数据分析,而不必了解所有基础计算。 这意味着团队中的任何人都可以在需要时介入并分析qPCR数据。
提高您的团队节省时间和金钱的效率
放心地将qPCR数据质量控制和标准化委托给您的团队!
qbase +包含有关数据规范化,注释和存储的内置专家知识。
qbase +软件的功能:- QPCR分析
- 及时分析PCR数据
- 执行详细的计算和分析
- 包含来自权威来源的4,500多个报价
- 支持RDML文件和具有Cq值的提取文件
geNorm
geNorm是在给定的实验条件下从一组经过测试的候选参考基因中找到稳定参考基因的最流行算法。由此,可以基于所选参考基因的几何平均值计算每个样品的基因表达归一化因子。
与Microsoft Excel的前身相比,geNorm的qbase +实现提供了五个重大好处:
全自动计算
处理丢失的数据
专家报告可深入了解您的结果
允许对候选参考基因进行排名,直至单个最稳定的基因
快二十倍
其他资源:
geNorm论文(Vandesompele等人,Genome Biology,2002)
关于geNorm和全局均值归一化的免费培训视频
我们的常青博客文章:使用参考基因进行RT-qPCR数据归一化的四个技巧
标准化策略
Jan Hellemans和Jo Vandesompele的可持续研究方法带来了一套革命性的标准化方法。这些方法已在qbase +中实现,以适应各种有特殊需求的实验:
多参考基因归一化,它考虑了多个稳定表达的参考基因,可将大多数实验可靠地归一化
全局平均归一化检查所有目标以进行归一化,对于测量大量无偏基因的实验(例如全基因组miRNA分析)有用
用户定义的归一化因子,可基于用户提供的值进行归一化
其他资源:
关于全球平均标准化的网络研讨会
miRNA表达谱分析-从参考基因到总体平均归一化(D'haene et al。,2012,Methods Mol Biol)
有关如何找到稳定表达的microRNA的博客文章
质量控制
在得出结论之前,必须评估qPCR后数据的质量并丢弃不符合预定义标准的数据点。 qbase +是此过程中的关键工具,提供多种类型的质量控制:
稀释系列的扩增效率评估
控制PCR复制变异
阳性和阴性对照样品的评估
确定参考基因表达的稳定性
偏离样本归一化因子的评估
批间校准的质量控制
样品质量控制(平均表达水平,表达的基因比例)
统计
集成的统计分析向导消除了对生物统计学的深入了解的需要。进行qPCR分析的生物学家将能够在没有统计学家帮助的情况下生成和解释统计结果。
其他资源:
基因表达数据生物统计学分析的七个技巧,必读博客文章
统计思考的非数学指南:直观的生物统计学
批间校准
每当需要比较以不同运行方式测量的样品时,应谨慎对待潜在的偏差。批间校准是一种计算程序,用于检测和消除(通常是低估了)批间差异。
强烈建议将qbase +用于此类数据处理:
避免计算错误
使用正确的错误传播
可以使用多个运行间校准器进行运行间校准,这使其更加准确并允许质量控制
归一化后进行运行间校准,从而允许从运行间校准物RNA样品中重新合成cDNA
CNV分析
在单个程序中进行质量控制,规范化,副本号调用和可视化:
可以使用多个参考样本进行更准确的副本编号调用
可以使用具有不同拷贝数的参考样品
用户定义的阈值,用于普通副本号码呼叫的上下边界
每个样本显示的拷贝数
有条件的条形着色便于检测基因拷贝数变化
MIQE和RDML
《发布定量实时PCR实验指南的最低限度信息》(Bustin等,临床化学,2009年)的目的是为作者,评论者和编辑者提供qPCR实验必须报告的最低限度信息的规范。 MIQE确保其相关性,准确性,正确的解释和可重复性。
使用qbase +可以轻松执行严格的MIQE兼容过程。它指导您获得最高质量的结果。经过分析和注释的实验可以轻松导出到RDML文件,该文件可用作发布的补充数据。
开放格式
无论您使用哪种qPCR仪器或计算机操作系统。无论您执行哪种实验。 qbase +提供了优雅的解决方案:
适用于Windows,Mac和Linux
接受大多数实时PCR仪器中具有Cq值的导出文件:
应用生物系统:5700、7000、7300、7500、7900,StepOne,StepOnePlus,ViiA7,OpenArray
伯乐(Bio-Rad):iCycler,iQ5,MiiQ,Opticon,Opticon2,Mi
系统要求 Windows 7 / 8.1 / 10 图片 安装指南 在Crack文件夹的自述文件中列出。
联系8020169@qq.com