论坛风格切换
 
  • 帖子
  • 日志
  • 用户
  • 版块
  • 群组
帖子
购买邀请后未收到邀请联系sdbeta@qq.com
  • 4825阅读
  • 2回复

[网络应用]Sentieon 2025.2 激活 支持集群 [复制链接]

上一主题 下一主题
离线pony8000
 

发帖
53475
今日发帖
最后登录
2025-05-20
只看楼主 倒序阅读 使用道具 楼主  发表于: 2016-11-21 09:36:53
Sentieon持续为业界提供高性能的NGS数据分析软件。我们根据用户的需求与反馈,持续迭代改进Sentieon软件包。
Sentieon软件为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台,对短读长NGS、长读长longread测序数据进行SNP/INDEL/SV分析。最高支持20万人全基因组联合变异检测分析。
Sentieon为完整的纯软件二次分析解决方案,该方案涵盖了从基因比对到变异检测的全部流程,可同时用于胚系突变检测和体细胞突变检测。全面支持主流二、三代测序平台,包括illumina、MGI、PacBio、Nanopore、Genemind、IonTorrent、Ultima、Element等。


      Sentieon软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型,在保证结果完全匹配GATK/BWA金标准的前提下,分析效率提升10倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,最大可处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。为了方便用户自定义BAM流程,Sentieon提供了Python API Engine。提供UMI模块,替代Fgbio/picard,在更高精度的条件下UMI分析速度提升20倍。提供替代STAR的加速模块,为单细胞测序RNA-seq提供加速计算。

     Enabling Precision Data for Precision Medicine
Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型,在保证完全匹配GATK/BWA结果的前提下,计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据分析效率。


       Sentieon 致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈,通过算法的深度优化和企业级的软件工程,大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。       Sentieon为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、动植物研究等多个领域的合作伙伴和科研机构提供软件解决方案,共同推动基因技术的发展,实现“成就精准数据,服务精准医疗“的愿景。       毅硕科技(INSVAST)作为Sentieon Inc. 大中华区授权服务机构,我们将始终本着真诚的态度和专业的精神,坚持并维护Sentieon Inc. 愿景,为大中华区客户提供优质的服务。
      Sentieon为完整的纯软件二次分析解决方案,该方案涵盖了从基因比对到变异检测的全部流程,可同时用于胚系突变检测和体细胞突变检测。全面支持主流二、三代测序平台,包括illumina、MGI、PacBio、Nanopore、Genemind、IonTorrent、Ultima、Element等。

      Sentieon软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型,在保证结果完全匹配GATK/BWA金标准的前提下,分析效率提升10倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,最大可处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。为了方便用户自定义BAM流程,Sentieon提供了Python API Engine。提供UMI模块,替代Fgbio/picard,在更高精度的条件下UMI分析速度提升20倍。提供替代STAR的加速模块,为单细胞测序RNA-seq提供加速计算。

Sentieon DNAseq应用流程
Sentieon RNA Pipeline
Sentieon比GATK4要快5到20倍
Sentieon DNAseq结果与GATK结果保持一致
Sentieon 单次Calling最大10万个WGS样本
Sentieon提供Python API接口
解决方案 软件模块 软件兼容 行业认证 客户分布
解决方案

软件模块


      Sentieon软件的使用非常灵活。用户可以直接使用完整Pipeline流程,也可以根据需要单独调用相关模块去替换原流程中的模块。Sentieon模块的输入、输出文件严格按照生信行业规范进行操作,用户可轻松上手,大大降低学习难度和学习时间。

主要模块的应用流程
      Sentieon软件为从BWA、GATK、MuTect、MuTect2、Picard切换到Sentieon运行环境的用户,提供了完善的无缝的脚本和示例供用户使用,可参考本页面内的资料下载栏目,下载想要文档进行学习参考。同时为用户方便进行在线学习,我们提供了完善的帮助系统:  

软件兼容性
      在基因计算领域,因为GATK是针对x86指令集开发的,使用没有针对ARM专门优化的GATK将比在x86处理器上要缓慢很多,基因行业很难享受到ARM处理器的低成本优势。因此,我们对Sentieon软件的所有模块针对ARM指令集进行了全面的优化和评测,于2019年11月底推出Sentieon Genomics for ARM软件包,全面支持基于ARMv8架构的处理器,包括AWS Graviton、华为鲲鹏920、AMPERE Altra和阿里云的ARM方案。在保证结果和x86处理器一致的前提下,将已经降低了的基因计算的成本再次降低30%或以上。至此,Sentieon全面兼容从云、超算中心、本地服务器的X86和ARM架构计算。
Sentieon软件已被1200多家商业公司和科研机构使用,得到广泛认可。到2022年8月为止,Sentieon软件已经运行处理的数据量超过2700PB,样本量达数百万,时长超过4亿7千万核时。截止2022年第三季度,在包括NEJM、Cell、Nature等世界一级影响因子的刊物上被引用次数多达650篇。
完美激活支持集群,永久激活。联系1739083603@qq.com
软件下载咨询邮箱: sdbeta@qq.com (回复及时)
 
精品软件:百度搜闪电软件园  最新软件百度搜:闪电下载吧
有问题联系 sdbeta@qq.com
离线vbxchw99

发帖
44
今日发帖
最后登录
2018-10-14
只看该作者 沙发  发表于: 2017-10-07 21:06:07
[s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137][s:137]
离线akiloveme

发帖
4129
今日发帖
最后登录
2025-06-01
只看该作者 板凳  发表于: 2025-05-26 11:58:37