MOE由Chemical Computing Group公司推出的Molecular Operating Environment(简称MOE)软件不失为一款全新设计的极具竞争性的新软件。MOE能够在 Windows , Linux和UNIX，如SGI IRIX,SUN SOLARIS,HP-UX,IBM AIX等系统下运行，有图形界面和命令行方式，还可以配置在服务器上供网络用户使用。此外，MOE还提供了脚本语言Scientific Vector Language(简称SVL),可以由用户编程实现各种自定义的功能。实际上，MOE自身也是通过内置的SVL程序实现。 MOE的应用范畴 MOE在生物信息学、化学信息学、高通量研究、分子设计、蛋白质模拟、分子模拟等领域都有应用。在生物信息学方面如同源序列标识、对比;化学信息学方面如结构描述子计算及结构相似性与差异性表征、构象数据库、三维结构查询、药效团定位等;在高通量研究方面有高通量筛选分析、二叉构效关系研究、组合化学分子库合成等;在分子设计方面有活性位点探测、分子对接、碎片分析等;在蛋白质模拟方面有同源模拟、突变进化、力学分析等;在分子模拟方面有力场和静电势分析、动力学研究、三维分子建造、分子表面研究等。除此以外，MOE在计算技术上还支持集成式和分布式运算。
MOE能够在 Windows , Linux和UNIX，如SGI IRIX,SUN SOLARIS,HP-UX,IBM AIX等系统下运行，有图形界面和命令行方式，还可以配置在服务
器上供网络用户使用。此外，MOE还提供了脚本语言Scientific Vector Language(简称SVL),可以由用户编程实现各种自定义的功能。实际上
，MOE自身也是通过内置的SVL程序实现。 MOE的应用范畴 MOE在生物信息学、化学信息学、高通量研究、分子设计、蛋白质模拟、分子
模拟等领域都有应用。在生物信息学方面如同源序列标识、对比;化学信息学方面如结构描述子计算及结构相似性与差异性表征、构象数据库
、三维结构查询、药效团定位等;在高通量研究方面有高通量筛选分析、二叉构效关系研究、组合化学分子库合成等;在分子设计方面有活性
位点探测、分子对接、碎片分析等;在蛋白质模拟方面有同源模拟、突变进化、力学分析等;在分子模拟方面有力场和静电势分析、动力学研
究、三维分子建造、分子表面研究等。除此以外，MOE在计算技术上还支持集成式和分布式运算。
Chemical Computing Group MOE (Molecular Operating Environment) 2019 | 5.1G
MOE is a software system designed to support Cheminformatics, Molecular Modelling, Bioinformatics, Virtual Screening, Structure-based-design and can be used to build new applications based on SVL (Scientific Vector Language). Given the breadth of uses this review can only highlight a small part of the potential scope.
The main window of MOE shows the default interface, the top menu bar provides access to a range of applications and tools, below the top menu the is a commandline interface that can be used to input SVL commands. The buttons to the right of the rendering area are short cuts to commands that are often buried several levels down in the top menu system, these are also available by pressing the alt key.. These include many of the rendering and labelling options, angle and distance measurements, and access to the molecular builder. At the foot of the window are dials used for rotating, translating and zooming. These actions can also be accessed using the mouse by pressing combinations of the alt, ctrl and shift keys, or using the middle button of a tree-button mouse.
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